就欧洲大陆而言，每年约有30万左右的宝宝是透过试管婴儿(IVF)或单一精虫显微注射(ICSI)方式而诞生；过去的研究认为这两种受孕方式制造出来的宝宝在畸形率方面并无差异。
但在2005年Hansen学者综合统计历年来25个大大小小的研究，发现ICSI宝宝比IVF宝宝有较高的畸形率，特别是心血管系统及泌尿系统(如尿道下裂)。
为了更清楚比较IVF及ICSI的差异，丹麦学者Jens Fedder启动了更大型的研究。以412位ICSI宝宝和传统试管婴儿宝宝，分别在性别、染色体异常及重大畸形方面进行比较。结果发现，ICSI宝宝中女性比率较高，为(54.5%)，畸形方面除了男宝宝尿道下裂发生率较高外，其余重大畸形和IVF或自然受孕的宝宝比较并没有任何差别。
ICSI宝贝女性比率偏高的原因，可能是其父亲先天的Y染色体异常，导致精虫减少，同时男性胚胎带着来自父亲的一个异常的Y染色体，要发展成正常胚胎或着床怀孕都有一定的困难度，相对的女性胚胎没有这个问题，因此较容易着床，使得生下女宝宝的机率大增。
目前研究显示，男宝宝发生尿道下裂的先天异常比率有逐年提升的趋势，这可能和整个大环境是单一精虫显微注射造成，甚至和患者本身异常的Y基因也有有关。
至于先天心脏疾病的发生率，ICSI宝宝并不会比一般的宝宝来得高。而染色体异常部份，和怀孕的方式较无关系，反倒和母亲年纪大小有关，年纪越大，宝宝染色体异常率便较高。
